Sbírka fytopatogenních virů (VURV–V), VÚRV, v. v. i., Praha
V 80. letech minulého století vznikla potřeba katalogizovat některé
izoláty virů, se kterými se pracovalo na pracovišti virologie VURV v
Praze-Ruzyni. Sbírka se postupně rozrůstala tak, jak se zvyšovaly počty
izolátů virů a počet řešených výzkumných projektů.
• Charakteristika sbírky (kmenů), počty kultur
Ve sbírce jsou udržovány hospodářsky významné viry obilnin, zeleniny, ovocných dřevin, chmele a révy vinné.
Sbírka obsahuje 91 různých kmenů a izolátů fytopatogenních virů
rostlin a tři izoláty evropské žloutenky peckovin. Počty položek sbírky
se mění tak, jak jsou z přírodních zdrojů získávány nové izoláty. Sbírka
obsahuje kmeny a izoláty Agropyron mosaic virus, Alfalfa mosaic virus,
Apple chlorotic leaf spot virus, Apple mosaic virus, Apple stem grooving virus, Apple stem
pitting virus, Arabis mosaic virus, Barley yellow dwarf virus, Bean common
mosaic virus, Beet chlorosis virus, Beet yellows virus, Broad bean wilt virus-1, Broad bean
wilt virus-2, Brome mosaic virus, Cauliflower mosaic virus, Cherry leaf roll virus,
Cocksfoot streak virus, Cucumber mosaic virus, European mountain ash ringspot-associated virus,
Grapevine fleck virus, Grapevine leafroll-associated virus 1-A,
Grapevine leafroll-associated virus 1-B, Grapevine rupestris vein feathering virus,
Grapevine virus A, Grapevine virus B, Hop mosaic virus, Lettuce
mosaic virus, Lolium latent virus, Myrobalan latent ring spot virus, Oat
necrotic mottle virus, Pea enation mosaic virus, Pepper mild mottle virus, Pleione flower breaking
virus, Plum pox virus, Potato potyvirus Y, Prunus necrotic ringspot virus, Rupestris stem pitting associated virus, Ryegrass mosaic virus, Squash mosaic virus, Strawberry latent ring spot
virus, Tobacco ringspot virus, Tomato aspermy virus, Tomato mosaic
virus, Turnip mosaic virus, Turnip yellow mosaic virus, Watermelon
mosaic virus 2, Wheat dwarf virus, Wheat streak mosaic virus a Zucchini
yellow mosaic virus.
• Aktivity/výzkumné aktivity, služby
Jednotlivé izoláty virů sbírky jsou využívány při expertní činnosti jako srovnávací
standardy; jsou používány nejen při výzkumu např. rezistence rostlin,
ale také pro vyloučení falešných pozitivních nálezů příměsí GMO rostlin
(CaMV); jsou poskytovány dalším zájemcům pro studium a výzkum. Postupně
jsou izoláty virů sbírky charakterizovány biologicky a molekulárně.
• Metody uchovávání
Stabilní fytoviry a izoláty virů jsou udržovány v uzavřených nádobách v dehydratovaných listech, které jsou uchovávány při teplotě +2 až +6 °C a zároveň konzervovány v
zamraženém stavu při teplotě -70 °C, aby byla zajištěna záloha pro
případ ztráty infekčnosti zasušeného izolátu. Dále je využívána
lyofylizace a kryokonzervace v tekutém dusíku. Fytoviry, které nesnášejí
uvedené způsoby konzervace, jsou udržovány pasážováním na živých
hostitelských rostlinách mechanicky nebo pomocí hmyzího vektoru, např.
mšicemi (Myzus persicae, Rhopalosiphum padi) nebo pomocí kříska polního
(Psammotettix alienus). Infikované rostliny jsou pěstovány izolovaně ve
skleníkových kójích, dřeviny a réva vinná v technickém izolátu.
• Systémy kvality, interní normy, správná laboratorní praxe
Jednotlivé izoláty virů sbírky jsou pravidelně dle předpokládané stability v neaktivním stavu pasážovány na nové
hostitelské rostliny izolovaně ve skleníkových kójích v různých
termínech tak, aby nemohlo dojít k záměně nebo smíšení jednotlivých
izolátů. Pracovník zodpovědný za svěřený izolát viru zjišťuje přítomnost
viru v hostitelské rostlině hodnocením příznaků a pomocí ELISA, PCR nebo
elektronovou mikroskopií. Rostliny infikované karanténními viry lze
pěstovat pouze ve speciálním izolovaném karanténním skleníku. Izoláty
těchto virů nelze vyměňovat s dalšími pracovišti bez předchozího
souhlasu MŽP.
• Začlenění do národních a mezinárodních organizací/platforem
Řešitelé jsou členy European Plant Protection
Organization, Panel on Fruit Tree Viruses, International Council for the
Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine, Temperate Fruit
Virus Working Group, International Society for Horticultural Science
(ISHS), International Working Group on Legume and Vegetable Viruses,
Small Fruit Virus Working Group, Plum Pox Working Group, European
Foundation for Plant Pathology, International Foundation for Science –
Stockholm, International Society for Horticultural Science, European
Association for Research on Plant Breeding (EUCARPIA), Julius
Kühn-Institut (JKI) Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen,
Quedlinburg, The American Phytopathological Society (APS).
Využití sbírky:
• Využití kmenů a izolátů
Viry sbírky jsou podle potřeby používány jako pozitivní kontrola při určování virů obilovin, zeleniny,
ovocných dřevin a révy vinné. V této funkci jsou při expertní činnosti
pro správnou diagnostiku zcela nezastupitelné. Viry sbírky slouží jako
zdroj infekčního materiálu pro testování kandidátských rezistentních
odrůd, ověřování odolnosti rostlin proti těmto virům, a pro porovnávání
příznaků na indikátorových rostlinách při diagnostice těchto virů. Virů
sbírky se využívá při řešení výzkumných projektů. Vzorky ze sbírky virů
jsou na požádání k dispozici všem výzkumným, vysokoškolským a
diagnostickým pracovištím v ČR.
• Uživatelé, klienti – ČZU Praha,
Katedra ochrany rostlin, – MZLU Brno, ZF Lednice, ústav ovocnictví, –
VŠÚO Holovousy s.r.o., – SEMO Smržice, – jednotliví vědečtí pracovníci VÚRV, v.v.i.
Kontakt:
Pracoviště: VÚRV v.v.i Praha – Ruzyně, Odbor ochrany plodin a zdraví
rostlin (OOPZR)
Zodpovědný kurátor: Ing. Jana Brožová, Ph.D. e-mail:
brozova@vurv.cz, tel: 233022388
zástupce: Ing. Jan Ripl e-mail:
ripl@vurv.cz, tel. 233 022 468
|
     
|